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DNA才是最好的硬盘?数据存储危机加剧,中国科学家取得新突破

无人机

行业应用  2025-03-22 08:00:11

根(gēn)据(jù)国(guó)际(jì)数(shù)据(jù)公(gōng)司(sī)(IDC)的(de)预(yù)测(cè),到(dào)2025年(nián),全球(qiú)数(shù)据(jù)量(liàng)将(jiāng)达(dá)到(dào)175泽(zé)字(zì)节(jié)(ZB),相(xiāng)当(dāng)于(yú)每(měi)个(gè)人(rén)每(měi)天(tiān)产生约1.7 MB的数据。这种全球性的数据激增带来了一个巨大的挑战:如何高效、可持续地存储如此庞大的信息?

目前,传统的硬盘、固态硬盘和云存储是数据存储的主要方式。然而,它们的局限性也日益凸显。例如,硬盘和固态硬盘的存储密度增长速度赶不上数据增长的速度。这些传统存储介质的使用寿命一般也只有数年,需要频繁更换,增加了成本和资源消耗。此外,全球数据中心的能耗已经占到了全球总能耗的1%以上,这不仅耗费大量能源,还对环境产生了不利影响。

那么,有没有一种方式,既能高密度存储庞大的数据,又能长时间保持数据的完整性,同时还节能环保呢?

科学家们将目光投向了生命的载体——DNA。

DNA,作为遗传信息的载体,具有天然的优势:

• 超高储存密度:一克DNA理论上可以存储约215 PB(拍字节)的数据,相当于可以容纳 1千万小时的高清视频内容。

• 超长(zhǎng)保(bǎo)存(cún)时(shí)间(jiān):在(zài)适(shì)宜(yi)的(de)条(tiáo)件(jiàn)下(xià)(比(bǐ)如(rú)避(bì)免(miǎn)接(jiē)触(chù)湿(shī)气(qì)和(hé)紫(zǐ)外(wài)线(xiàn),因(yīn)为(wèi)它(tā)们(men)会(huì)破(pò)坏(huài)分(fēn)子(zi)结(jié)构(gòu)),DNA 的(de)化(huà)学(xué)稳(wěn)定(dìng)性(xìng)允(yǔn)许(xǔ)其(qí)保(bǎo)存(cún)数(shù)十(shí)万(wàn)年(nián)。

• 环(huán)境(jìng)友(you)好(hǎo):DNA是(shì)一(yī)种不需要持续供电的存储介质,能耗极低,有助于降低数据存储对环境的影响。

那么DNA如何储存信息呢?

我们可以把DNA想象成一本由四个字母组成的书,这四个字(zì)母分别是A(腺嘌呤)、T(胸腺嘧啶)、C(胞嘧啶)和G(鸟嘌呤),也就是四种碱基。这四种碱基各自与脱氧核糖和磷酸结合可形成相应的核苷酸,然后再通过不同的排列组合,形成了DNA的序列,就像文字的组合构成了书中的内容。在生物体中,这些序列编码了遗传信息,指导着生命的生长、发育和功能。

在数据存储中,科学家们借鉴了这一原理,将数字信息转换为DNA的(de)碱(jiǎn)基序列。例如,可以将二进制的“0”和“1”对应到特定的碱基上,或者通过特定的编码规则,将数据映射为一段DNA序列。但(dàn)问(wèn)题是传统方法需要从头合成新的DNA链,这一过程既昂贵又缓慢。此外,长链DNA合成也容易出错,影响数据的准确性和可靠性。

那我们是否有办法突破这些瓶颈呢?

2024年10月23日,在一篇发表于《自然》杂志上的论文中,一个由中国科学家领导的团队受到表观遗传学的启发,开发了一种用(yòng)DNA储(chǔ)存(cún)数(shù)据(jù)的(de)新(xīn)技(jì)术(shù)——“表(biǎo)观(guān)比(bǐ)特(tè)”储(chǔ)存(cún)技(jì)术(shù)。

什(shén)么(me)是(shì)表(biǎo)观(guān)遗(yí)传(chuán)学(xué)呢(ne)?我(wǒ)们(men)继(jì)续(xù)把DNA想(xiǎng)象(xiàng)成(chéng)一(yī)本(běn)书(shū),里(lǐ)面(miàn)的(de)文字(zì)代(dài)表(biǎo)我(wǒ)们(men)的(de)基(jī)因(yīn)信(xìn)息(xi)。表(biǎo)观(guān)遗(yí)传(chuán)学(xué)就(jiù)好(hǎo)比(bǐ)在(zài)这(zhè)本(běn)书(shū)的(de)特(tè)定文字上做标记(如加粗、下划线),不改变文字本身,但可以影响对内容的理解和解读。

在生物学中,表观遗传修饰通过在DNA的特定碱基上添加或移除化学基团,比如甲基(CH₃),来调节基因的表达。这种调节可以影响细胞功能,甚至决定基因是否被“打开”或“关闭”。

研究人员利用了DNA链上特定碱基的甲基化和去甲基化来表示二进制信息:

•甲基化的碱基:表示二进制的“1”。

•未甲基化的碱基:表示二进制的“0”。

这种“表观比特”类似于传统的比特。这种新技术不依赖于从头合成DNA,而是利用现有的DNA分子进行数据存储,就像在纸上印刷文字一样,无需重新制造纸张。

表观遗传信息储存的机制。 图:ChengZhang et al.

在论文中,研究人员提出了一种基于并行写入策略的DNA储存策略。他们设计并预制了一个通用的单链DNA载体,可以看作是数据存储的“纸张”。他们还设计了一系列互补的短单链DNA,称为“文字库”,这些短链DNA能够与载体的特定位置配对结合,就像印刷活字中的字模。通过将“文字库”加载到(dào)DNA载(zài)体(tǐ)的相同位置上,可以排列组合出所需的“表观比特”信息,类似于将活字排版在印刷版上。

接下来,利用酶的作用,就可以对DNA载体上的特定碱基进行甲基化修饰。这种选择性甲基化是并行进行的,意味着可以同时在多个位置上进行修饰,大幅提高效率。通过上述步骤,数据被稳定地“打印”在DNA载体上,完成了一次精密而高效的“分子印刷术”。

在实验中,研究团队仅使用了700种DNA活字和5个DNA模板,通过不同的组合,就可以编程出大量的数据。在自动化的实验平台上,他们实现了约27.5万个比特的数据写入,每次反应可以写入350比特的数据。

新研究表明,DNA存储的潜力正在逐渐显现。凭借其高密度、长寿命和低能耗的特点,DNA或许能成为未来解决数据存储危机的关键。在这条探索的道路上,“表观比特”技术迈出了重要一步,让人类看到了自然智慧与科技创新结合的无限可能。

或许有一天,我们真的可以将全人类的知识和记忆,凝聚在微小的DNA分子中。

本文为·创作培育计划扶持作品

作者名称:沈雯

审核:梁前进 北京师范大学生命科学学院 教授

出品:中国科协科普部

监制:中国科学技术出版社有限公司、北京中科星河文化传媒有限公司

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